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华体会-预测蛋白质序列的新AI模型问世—新闻—科学网

发布日期:2024-10-26 作者:华体会

利用CARBonAra进行序列猜测(示意图)。图片来历:瑞士洛桑联邦理工学院

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科技日报北京8月8日电 (记者张佳欣)瑞士洛桑联邦理工学院开辟了一种名为CARBonAra的新型人工智能(AI)驱动模子。该模子可以按照分歧份子情况所施加限制的主链支架猜测卵白质序列,有望在卵白质工程和包罗医学和生物手艺在内的多个范畴带来重猛进展。这一功效颁发在最新一期《天然 通信》杂志上。

CARBonAra是在一个包括约370000个亚基的数据集长进行练习的。它还从卵白质数据库中额外拔取了100000个亚基用在验证,70000个亚基用在测试。

CARBonAra成立在该团队开辟的卵白质布局转换器框架的根本上。它利用了几何转换器,是一种深度进修模子,可以处置点之间的空间关系(如原子坐标),以进修和猜测复杂的布局。该模子凸起特点是“上下文”感知能力,这在提高序列恢复率方面尤其较着。

当CARBonAra包括份子“上下文”,如卵白质与其他卵白质、核酸、脂质或离子的界面时,其恢复率显著提高。

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该模子不但在合成基准测试中表示超卓,还颠末了尝试验证,其矫捷性和正确性为卵白质工程斥地了新的路子,加强了将来药物发现的能力。CARBonAra在酶工程方面的成功也展现了其在工业利用中的潜力。

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